국내에서 비교적 이름이 생소했던 그가 일약 한국이 낳은 세계적 ‘스타’로 알려지게 된 것은 2002년 12월 〈KBS 김동건의 한국 한국인〉프로그램에 출연하면서부터였다. 이때 ‘동양인 최초 최연소 홉킨스대 종신교수’라는 수식어를 달게 된 그는 유명세를 사업을 벌이는 데 활용했다.   하지만 그 과정에서 부적절한 스캔들이 끊임없이 터져나왔다. 한 측근은 문 박사를 향해 ‘샴페인을 너무 일찍 터트렸다’라고 표현했다. 고급 외제 차를 수집하는 취미를 갖는가 하면 미국에 호화 요트를 갖고(타임셰어), 볼티모어에는 200만 달러짜리 저택을 소유하고 있기도 하다. 2005년에는 서울 캔젠 지사에서 정식으로 고용한 자기 여비서를 미국에 출장 보내 성추행하려 한 혐의로 고소당해 재판 끝에 6만 달러를 물어주기도 했다. 최근에는 일본에서 고급 외제 차를 주문했다가 대금 지급 문제로 분쟁이 발생해 사기 혐의로 일본 검찰에 고소당한 일도 있다.

문 박사의 가족과 주변에서는 그가 의학자로서 암연구에 몰두하는 대신 사업 세계에 뛰어든 것이 오늘의 화근을 자초했다고 보는 이들이 많다. 통상 4년이 넘는 박사학위 과정을 2년 반 만에 이수한 젊은 시절 그의 학업 성취 능력으로 볼 때 연구자의 길에 매진했더라면 대성했을 것이라는 아쉬움이다.